Shin Megami Tensei V: Vengeance consiste em duas histórias completas: experimenta o novo percurso "Canon of Vengeance", uma história dramática em que os caídos se irão vingar.
Este percurso traz novas personagens e um grupo de demónios enigmáticos, as Qadištu, que têm planos sombrios distantes da guerra entre aqueles que lutam para manter ou desafiar a ordem.
Ou então explora a história original de Shin Megami Tensei V, o "Canon of Creation" - um eterno conflito entre anjos e demónios no qual o protagonista luta pelo destino do mundo.